H Βίλλυ Τσάκωνα από το 2005 έχει διδάξει μαθήματα γλωσσολογίας στα Πανεπιστήμια Αθηνών, Ιωαννίνων, Πατρών και Αιγαίου. Από το 2010 έχει εκλεγεί Επίκουρη Καθηγήτρια Κοινωνιογλωσσολογίας και Ανάλυσης Λόγου στο Τμήμα Επιστημών της Εκπαίδευσης στην Προσχολική Ηλικία του Δημοκρίτειου Πανεπιστημίου Θράκης. Τα κύρια ερευνητικά της ενδιαφέροντα περιλαμβάνουν, εκτός από την έρευνα του χιούμορ, την ανάλυση του πολιτικού και του αφηγηματικού λόγου, καθώς και εκπαιδευτικές εφαρμογές στο πλαίσιο του κριτικού γραμματισμού.