Η Ελένη Ε. Κούκκου ήταν ιστορικός, καθηγήτρια στη Φιλοσοφική Σχολή του Πανεπιστημίου Αθηνών. Υπήρξε μέλος της πενταμελούς επιστημονικής επιτροπής στην οποία ανέθεσε το Ιστορικό και Αρχαιολογικό Τμήμα του Πανεπιστημίου Αθηνών τη μελέτη και την οργάνωση του Τμήματος Μεταπτυχιακών Σπουδών. Καρπός των πολύχρονων ερευνών της σε όλα τα αρχεία της Ελλάδος και στα σπουδαιότερα αρχεία της Ευρώπης και της Αμερικής ήταν η συγγραφή και έκδοση 62 αυτοτελών συγγραμμάτων και μελετών και περισσότερων από 300 άρθρων σε επιστημονικά περιοδικά. Επισκέφθηκε και μελέτησε δέκα φορές τα αρχεία της Μόσχας, της Πετρούπολης και της Οδησσού, με σημαντικότατα αποτελέσματα για την ελληνική ιστορία. Για τη ζωή και το έργο του Καποδίστρια αλλά και για άλλα θέματα της ελληνικής ιστορίας, έδωσε πολλές διαλέξεις σε πανεπιστήμια της Γαλλίας αλλά και στο Λονδίνο, στο Σικάγο, στη Νέα Υόρκη, στη Virginia, στη Σόφια, στο Βελιγράδι, στην Οδησσό, στην Κωνσταντινούπολη και στην Άγκυρα. Στις 25 Μαρτίου του 1994 ο Δήμαρχος της Οδησσού Λεονίντ Τσερνιένκο την τίμησε με δίπλωμα για την επιστημονική συμβολή της στη δημιουργία του Μουσείου της Φιλικής Εταιρίας. Επ’ ευκαιρία της ελληνικής προεδρίας στην ΕΟΚ το 1994, η Ελένη Ε. Κούκκου είχε επισήμως προσκληθεί από τον Δήμαρχο Κερκύρας στις εκδηλώσεις της Συνόδου Κορυφής. Τότε η Εταιρία Μελέτης της Ελληνικής Ιστορίας, με χορηγό το Ίδρυμα Α.Γ. Λεβέντη, μετέφρασε και εξέδωσε την εκτενή μελέτη της «John Capodistrias: A Greek Europhile Diplomat», χάρη στην οποία διεθνοποιήθηκε το γεγονός ότι ο Έλληνας διπλωμάτης και υπουργός Εξωτερικών της Ρωσίας αγωνιζόταν να πείσει τους Ευρωπαίους διπλωμάτες, ήδη από το 1817, για την αναγκαιότητα μιας ενοποίησης «γύρω από μιαν κοινήν πατρίδα, την Ηνωμένην Ευρώπην». Στις 26 Σεπτεμβρίου 1999, παραμονή της επετείου της τραγικής δολοφονίας του Ιωάννη Καποδίστρια, ο Δήμος Ναυπλιέων ανακήρυξε την Ελένη Ε. Κούκκου επίτιμο δημότη της ιστορικής αυτής πρώτης πρωτεύουσας του ελληνικού κράτους. Στις 10 Φεβρουαρίου 2000 –ημερομηνία της γέννησης του Καποδίστρια – ο Δήμος Αθηναίων της απένειμε το «Μετάλλιο της πόλεως των Αθηνών». Η Ελένη Ε. Κούκκου πέθανε στην Αθήνα τον Μάρτιο του 2007. Από τις Εκδόσεις Πατάκη κυκλοφορούν τα έργα της «Ιωάννης Καποδίστριας – Ο άνθρωπος, ο Ευρωπαίος διπλωμάτης, 1800-1828» (Βραβείο Ακαδημίας Αθηνών) και «Ιωάννης Α. Καποδίστριας, Ρωξάνδρα Σ. Στούρτζα – Μια ανεκπλήρωτη αγάπη» (ιστορική βιογραφία).